Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tdrd12Q9CWU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms