Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms