Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a2Q9CTG6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a2Q9CTG6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a2Q9CTG6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a2Q9CTG6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a2Q9CTG6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a2Q9CTG6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp13a2Q9CTG6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp13a2Q9CTG6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms