Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms