Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PompQ9CQT5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PompQ9CQT5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PompQ9CQT5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PompQ9CQT5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PompQ9CQT5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PompQ9CQT5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms