Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ncbp2Q9CQ49 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ncbp2Q9CQ49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms