Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt23Q99PS0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt23Q99PS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms