Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b1Q99NB9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms