Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acss1Q99NB1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Acss1Q99NB1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acss1Q99NB1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acss1Q99NB1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acss1Q99NB1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acss1Q99NB1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Acss1Q99NB1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acss1Q99NB1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms