Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl3Q99N95 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms