Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms