Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nmd3Q99L48 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms