Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1aQ99L02 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms