Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrabdQ99JY4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms