Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmd6Q99JI4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmd6Q99JI4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms