Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prpf3Q922U1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms