Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf7Q922B6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms