Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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