Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Afg3l1Q920A7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms