Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csde1Q91W50 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms