Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms