Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk8Q8R3L8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms