Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim29Q8R2Q0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.4 ms