Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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