Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxn4Q8K3Q3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms