Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccm2Q8K2Y9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms