Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms