Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6bQ8K2H2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms