Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms