Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q4Q8HWB2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q4Q8HWB2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms