Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CopaQ8CIE6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CopaQ8CIE6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms