Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tshz3Q8CGV9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tshz3Q8CGV9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tshz3Q8CGV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tshz3Q8CGV9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms