Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms