Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030452D12RikQ8CD33 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms