Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
N4bp3Q8C7U1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
N4bp3Q8C7U1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms