Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21aQ8C0S4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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