Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc169Q8BXX9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms