Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4aQ8BW72 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms