Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx17Q8BVL3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms