Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms