Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zcchc4Q8BKW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms