Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jmjd4Q8BFT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms