Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl42Q8BFQ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl42Q8BFQ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms