Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actr5Q80US4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actr5Q80US4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actr5Q80US4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms