Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnf1Q7TSH7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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