Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actn1Q7TPR4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Actn1Q7TPR4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms