Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms