Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv1Q704Y3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms