Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.7 ms