Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2oQ6ZPJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms